MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 7261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017857	CAA	3	9	33	41	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017857	TTA	2	6	42	47	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017857	A	7	7	86	92	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017857	TGG	2	6	93	98	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017857	ATA	2	6	183	188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017857	GTGG	2	8	252	259	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017857	AACA	2	8	3041	3048	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017857	T	6	6	5193	5198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017857	CTT	2	6	5229	5234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017857	T	7	7	5245	5251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017857	TTC	2	6	5277	5282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017857	TCA	2	6	5296	5301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017857	CAG	3	9	5379	5387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017857	AT	3	6	5396	5401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017857	TTG	2	6	5408	5413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017857	AAG	2	6	5427	5432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017857	TTA	2	6	9917	9922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017857	GTTT	2	8	9932	9939	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017857	CTG	2	6	10866	10871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017857	A	6	6	13816	13821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017857	TGAA	2	8	13851	13858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017857	AAT	2	6	13881	13886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017857	AC	3	6	13916	13921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017857	CATT	2	8	14032	14039	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017857	GACA	2	8	14068	14075	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017857	GAC	2	6	14078	14083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017857	TAA	2	6	14469	14474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017857	A	9	9	14477	14485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017857	T	6	6	14510	14515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017857	TCG	2	6	16217	16222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017857	TCC	2	6	16528	16533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017857	A	6	6	16543	16548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017857	A	6	6	16614	16619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017857	TGCT	2	8	16650	16657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017857	AGTC	2	8	17185	17192	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017857	ATT	2	6	17194	17199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017857	T	6	6	17207	17212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017857	AAC	2	6	17213	17218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017857	TTG	2	6	17231	17236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017857	CA	3	6	17243	17248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017857	T	6	6	17259	17264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017857	AG	3	6	18715	18720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017857	TGGG	2	8	18752	18759	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017857	T	6	6	18762	18767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017857	AAC	2	6	21093	21098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017857	TAA	2	6	21134	21139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017857	ATT	2	6	21142	21147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017857	GCA	2	6	22521	22526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017857	TCAG	2	8	22527	22534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017857	CCA	2	6	22561	22566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017857	CAA	2	6	22588	22593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017857	A	6	6	22652	22657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017857	CAA	2	6	22781	22786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017857	CAA	2	6	22824	22829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017857	TACT	2	8	22879	22886	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017857	AT	3	6	23003	23008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017857	CTTAT	2	10	23019	23028	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017857	AAAC	2	8	23039	23046	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017857	TTG	2	6	23059	23064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017857	ACCA	2	8	23096	23103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017857	TCG	2	6	23252	23257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017857	CAG	2	6	23345	23350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017857	TGC	2	6	23382	23387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017857	AAAAC	2	10	25345	25354	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017857	TTGA	2	8	25371	25378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017857	A	7	7	25423	25429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017857	T	7	7	25444	25450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017857	AT	3	6	25479	25484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017857	T	6	6	25484	25489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017857	CT	3	6	25501	25506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017857	T	6	6	25523	25528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017857	A	6	6	27435	27440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017857	GTG	2	6	27484	27489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017857	TC	3	6	29326	29331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017857	CAA	2	6	29339	29344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017857	AAT	2	6	29365	29370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017857	TAA	2	6	29376	29381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017857	ATT	2	6	29438	29443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017857	T	6	6	31663	31668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017857	GTA	2	6	31737	31742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017857	T	6	6	31753	31758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017857	CTA	2	6	31812	31817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017857	CT	3	6	34263	34268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017857	CCA	2	6	34320	34325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017857	CTG	2	6	34326	34331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017857	TCG	2	6	34466	34471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017857	TTTA	2	8	34472	34479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017857	CTC	2	6	34496	34501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017857	GGC	2	6	34536	34541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017857	CTT	2	6	34602	34607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017857	TA	3	6	34634	34639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017857	ATGA	2	8	34705	34712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017857	CATA	2	8	34764	34771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017857	AGT	2	6	34820	34825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017857	GTGA	2	8	34905	34912	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017857	CGG	2	6	37536	37541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017857	AAC	2	6	43259	43264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017857	T	6	6	47008	47013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017857	TTA	2	6	49850	49855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017857	A	6	6	49891	49896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017857	T	7	7	49913	49919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017857	GCC	2	6	50476	50481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017857	GGC	2	6	50488	50493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017857	GTC	2	6	51225	51230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017857	TG	3	6	51256	51261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017857	CAT	2	6	61965	61970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017857	ATG	2	6	64760	64765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017857	TG	3	6	64764	64769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017857	AGT	2	6	64795	64800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017857	TTA	2	6	64801	64806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017857	CAA	2	6	64823	64828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017857	GT	3	6	64875	64880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017857	TA	4	8	64882	64889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017857	T	6	6	64903	64908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017857	CGAA	2	8	64910	64917	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017857	A	6	6	64916	64921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017857	CTA	2	6	67346	67351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017857	TTGG	2	8	67366	67373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017857	TCA	2	6	67411	67416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017857	CAG	2	6	67448	67453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017857	ATT	2	6	68587	68592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017857	T	6	6	68591	68596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017857	ATA	2	6	68597	68602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017857	TACA	2	8	68612	68619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017857	TTA	2	6	68622	68627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017857	ACA	2	6	69820	69825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017857	A	6	6	70984	70989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017857	TAT	2	6	71004	71009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017857	CCA	2	6	71067	71072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017857	GTA	2	6	71120	71125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017857	GTCG	2	8	71209	71216	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017857	TCCA	2	8	71265	71272	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017857	AAT	2	6	71303	71308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017857	CTC	2	6	71344	71349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017857	TTGA	2	8	71355	71362	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017857	GCT	2	6	71531	71536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017857	CAA	2	6	71600	71605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017857	A	7	7	71604	71610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017857	TGA	3	9	71675	71683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017857	T	6	6	71715	71720	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017857	TGA	2	6	71785	71790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017857	ATA	2	6	71841	71846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017857	AAT	2	6	73565	73570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017857	TATT	2	8	73663	73670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017857	A	6	6	80964	80969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017857	CTT	2	6	81022	81027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017857	TTC	2	6	81265	81270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017857	CAA	2	6	81447	81452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017857	GAG	2	6	81917	81922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017857	CAT	2	6	81926	81931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_017857	AATC	2	8	119885	119892	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
283	NC_017857	A	7	7	119922	119928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_017857	T	6	6	123072	123077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_017857	AAC	2	6	123131	123136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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462	NC_017857	ACA	2	6	227475	227480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
463	NC_017857	CTA	2	6	227481	227486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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465	NC_017857	ATG	2	6	227509	227514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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